Ο Ευμένης Π. Καραφυλλίδης αποφοίτησε από το Institute of Human Nutrition, Faculty of Medicine του Πανεπιστημίου Columbia της Νέας Υόρκης στις ΗΠΑ, με μεταπτυχιακό τίτλο Master in Human Nutrition το 2004. Επίσης είναι απόφοιτο του Πανεπιστημίου Leeds Μ. της Μεγάλης Βρετανίας με πτυχίο BSc (Hons) in Applied Human Nutrition and Dietetics (2002).

Έχει εργαστεί στο Εθνικό Σύστημα Υγείας της Μεγάλης Βρετανίας (U.K – N.H.S, Chase Farm Hospital North London, Primary Care North London, North Middlesex Hospital North London, St Anne s Hospital North London, Milton Keynes General District Hospital, Milton Keynes Health Promotion, Enfield Primary Care) σαν κλινικός διατολόγος-διατροφολόγος, με ειδίκευση στην προαγωγή της υγείας (health promotion) και τις κλινικές περιπτώσεις. Έχει διατελέσει Σύμβουλος Διατροφής στην εταιρία Friesland Coberco Dairy Foods Company στην Ολλανδία και μέλος της ομάδας συμβούλων διατροφής στην Friesland Hellas στην Ελλάδα. Καθώς και σύμβουλος διατροφής της ομάδας μπάσκετ του Αμαρουσίου.

Ο Ευμένης Π. Καραφυλλίδης από τον Ιούλιο του 2007 Διευθύνει το Διαιτολογικό Τμήμα του Νοσοκομείου Metropolitan  General (Τέως ΙΑΣΩ General). Κατά την καθημερινή του δραστηριότητα στο Metropolitan General είναι υπεύθυνος για την κατάρτιση του διαιτολογίου όλων των νοσηλευόμενων ασθενών. Παρέχει υπηρεσίες κλινικής διαιτολογίας σε επιλεγμένα παθολογικά και χειρουργικά  περιστατικά. Είναι υπεύθυνος εντερικής και παρεντερικής σίτισης όλων των τμημάτων, συμπεριλαμβανόμενου της ΜΕΘ της κλινικής. Παράλληλα συνεργάζεται με τις ογκολογικές ομάδες της κλινικής με σκοπό την υποστήριξη της θρέψης όλων των ογκολογικών ασθενών.

Επίσης διδάσκει το μάθημα της Διαιτολογικής Υποστήριξης Βαριατρικού Ασθενούς στο Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα σπουδών με τίτλο  «Προηγμένη Λαπαροσκοπική-Βαριατρική Χειρουργική» το οποίο ιδρύθηκε υπό την εποπτεία της Α΄Προπαιδευτικής Χειρουργικής κλινικής Γ.Ν.Α. «Ιπποκράτειο» και απευθύνεται αποκλειστικά σε ειδικευμένους χειρουργούς και ειδικευόμενους , διανύοντες τα δύο τελευταία έτη της ειδικότητος.

Είναι εμπνευστής και ιδρυτής του ιστοτόπου ΥouDiet στην Ελλάδα, Μεγ. Βρετανία, και ΗΠΑ, μέσω του οποίου παρέχονται συμβουλές και προγράμματα διατροφής σε εγγεγραμμένους χρήστες.